两者的区别有：
1、含义不同：祖籍是指祖父及以上父系祖先的长久居住地或祖父及以上父系祖先的出生地，又名祖居地或原籍。籍贯，指本人出生时祖父的居住地。
2、从属不同：籍贯一般从父系，个别从母系。祖籍一般是以父系祖先为主。除此之外，一个家族中的籍贯可能不同，但是祖籍一定是一致的。
户籍地并不一定是这个人的祖籍地或籍贯地，尤其在经济发达的地区和某些在新中国成立后才开始建设的新地方和近代才有很快发展的地方，大量的人的籍贯地不是户籍地，这些人一般都是改革开放后或在中国的计划经济时代按照当时国家的分配从外地迁移或近代时才移民到新地方的。按几千年来的中国的传统的说法，籍贯是祖籍地的一种表述，这是户籍与籍贯不同的地方。