生物威胁的来源有自然灾害、突发事件、生物恐怖事件、外来生物入侵等。
1、突发事件：突发事件指的是突然发生的，造成或者是可能造成严重社会危害，需采取应急处置措施予以应对的自然灾害、公共卫生事件、事故灾难以及社会安全事件；
2、自然灾害：指的是给人类生存带来危害或者是损害人类生活环境的自然形象；
3、外来生物入侵：是对于一个特定的生态系统和栖息环境来说，非本地的生物通过各种方式进入此生态系统，并对生态系统、物种、栖境以及人类健康带来威胁的现象；
4、生物恐怖事件：利用可在人和动物之间传染或者是人畜共患的感染媒介物，如原生动物，真菌等，将其制作成生物制剂，造成较多的人员、经济损失。
生物威胁指的是人们把战争、突发事件、自然灾害等各种因素导致的病源微生物大量地、突发地繁殖，给人类社会以及健康带来较大的的伤害。