合肥学院四年一贯制专业有：土木工程、工程管理。合肥学院和安徽水利水电职业技术学院合作举办四年一贯制，学制是四年，学生在安徽水利水电职业技术学院上学，毕业时发的是合肥学院的毕业生学位证。
根据《安徽省教育厅关于开展“四年一贯制”技术技能型本科人才培养模式改革试点工作的通知》文件，2014年起，学校开展“四年一贯制”技术技能型本科人才培养模式改革试点工作。
试点专业属本科层次，学制四年，学习地点在协议合作的高职院校，“四年一贯制”技术技能型本科专业院校报考代码单列，新生入学后不得变更学习地点及转专业。
根据《合肥学院学生学籍管理条例》、《合肥学院学士学位授予工作实施细则》，对符合毕业条件者，颁发合肥学院毕业证书，符合学士学位授予条件者，颁发合肥学院学士学位证书。
毕业证书格式依据《普通高等学校学生管理规定》（教育部令第41号）、《教育部关于当前加强高等学校学历证书规范管理的通知》（教学〔2002〕15号）和安徽省教育厅有关规定执行，严格按照招生时确定的办学类型和学习形式，以及学生招生录取时填报的个人信息，填写、颁发学历证书、学位证书及其他学业证书。