1、功能上的区别：寺是古代官署的名称，庙是供奉祭祀祖先的处所，庵特指女性修行者居住的寺庙。2、大小上的区别：“寺”与“庙”的规格要大于“庵”。3、宗教背景上的区别：“寺”和“庵”与佛教的关系更加密切，“庙”与道教更加紧密。4、时间上的区别：“庙”的出现时间最早，“庵”的出现时间最晚。
寺原本是政府机构，例如：鸿胪寺主掌外宾和朝会礼节、大理寺主掌刑狱，相当于现代的最高法院。庙在古代本是供奉祖宗的地方，比如皇家的太庙或者宗族的祠堂。
不对外开放的小寺院则称之为庵，寺与庵最大的区别在于有没有大雄宝殿，只有修建了大雄宝殿，才有资格称为寺，否则只能称为庵。
旧时文人的书斋亦称“庵”，如“老学庵”、“影梅庵”，汉以后建了一些专供佛徒尼姑居住的庵堂，于是“庵”也就成了佛教女子出家行佛事的专用建筑名称了。